耶氏肺孢子菌（Pneumocystisjirovecii）为一种机会性病原体,多见于免疫功能低下或免疫缺陷人群,如获得性免疫缺陷综合征患者，恶性肿瘤或血液病患者化疗后、器官移植患者长期服用抗排异药、风湿性关节炎患者使用免疫抑制剂治疗后，以及营养不良的婴儿等。

在阿吉安PathoSeq?病原微生物宏基因组检测从一位急诊科55岁男性患者的痰液样本中检出耶氏肺孢子菌（Pneumocystisjirovecii）序列，检出病原菌与患者“肝癌末次免疫治疗后2周，发热入院”主诉相关高度。

肺孢子菌

在分子生物学技术检测发展以前，人们对肺孢子菌属知甚少，而由于其兼具原虫及酵母菌特征，肺孢子菌一直被误认为原虫。过去曾将导致人体肺孢子菌肺炎的病原体称为卡氏肺孢子虫（Pneumocystisjirovecii），并将由该病原体导致的肺部疾患称为卡氏肺孢子虫肺炎（PneumocystisCariniiPneumonia，PCP）或肺孢子虫病（Pneumocystis)。直到20世纪80年代，越来越多的分子生物学证据表明，肺孢子虫实为真菌，导致人体肺部炎症的病原体是耶氏肺孢子菌（Pneumocystisjirovecii），而原先认为寄生于人体的卡氏肺孢子虫仅寄生于大鼠[1]。

肺孢子菌(Pneumocystis)归类于真菌界(Fungi)，子囊菌门(As